从小就能看见妖怪的少年夏目贵志。自从他从祖母玲子那里继承了与妖怪成为主从并将其名字书写在上的契约书“友人帐”以来，便与自称为保镖的妖怪猫咪老师一同，开始了将名字返还给妖怪的每一天。夏目与各种各样的妖怪与善良人们相遇，在构筑温暖的场所同时，也反复寄托着想要守护重要之物的想法。
从小就能看见妖怪的少年夏目贵志。自从他从祖母玲子那里继承了与妖怪成为主从并将其名字书写在上的契约书“友人帐”以来，便与自称为保镖的妖怪猫咪老师一同，开始了将名字返还给妖怪的每一天。夏目与各种各样的妖怪与善良人们相遇，在构筑温暖的场所同时，也反复寄托着想要守护重要之物的想法。
高中生夏目本来可以拥有平凡的高中生活，但是，他却能看到妖怪，并因此而苦恼。很多次，他都差点被妖怪夺去性命。一次偶然的机会，夏目巧遇猫神。猫神告诉他，夏目的外婆玲子有一本“友人帐”上面记录了所有被玲子打败的妖怪的名字，玲子死后，妖怪为夺回名字，才纠缠夏目。只有把妖怪的名字还给他们，夏目才能恢复宁静的生活。为了回到宁静的生活，夏目与猫神拿着“友人帐”开始了寻妖之旅，一段段关于妖怪的感人故事，就这样被引出。
拥有28万人口的三门市，其境内某天突然打开了一扇通往未知世界的大门。从大门的另一端，被称为“近界民”的怪物蜂拥而出。人类惊慌失措之余发现，地球现有的武器对近界民完全没有任何效果。危急时刻，神秘团体境界防卫组织“BORDER”出现击退近界民，三门市总算回归往昔的正常生活。如是过了四年半的时间，隐藏着作为“BORDER”成员身份的初中学生三云修（梶裕贵配音）和转学生空闲游真（村中知配音）相遇，而对方竟然是来自门另一头的近界民，此行的目的是为了找到自己的父亲。分出不同阵营的二人，注定要在命运的战争中激烈碰撞……
夏目的祖母玲子可以看见妖怪，并有很强的力量。但是被周围人疏远的她很早就离开了人世，只留下一本友人帐。友人帐里记录了曾经被玲子打败的妖怪的名字，且这些妖怪必须守护友人帐的主人。玲子去世后，这本友人帐留给了夏目。强大的友人帐吸引了各种妖怪的造访，给夏目带来不少麻烦，但是也引领夏目不断成长着。夏目追寻妖怪的记忆不断了解自己的祖母玲子，由于异于常人的禀赋，玲子在人群中总是形单影只异常的孤单。深深理解玲子的夏目一心想要找到能够理解自己内心的人，也在这个过程中看到自己和祖母的不同之处。虽然生命似乎总是弥漫着孤寂的味道
现正在白泉社旗下的少女漫画杂志《LaLa》上刊载的《夏目友人帐》，于白泉社的《夏目友人帐》官网上突然更新了一个天大喜讯——在2月24号发售的《LaLa4月号》，《夏目友人帐》将会迎来一个重大发表!是TV动画第三期吗?这对于夏目的fans来说也是值得高兴的消息。《夏目友人帐》的故事主要是说男主角夏目贵志，继承了祖母夏目玲子拥有看到妖怪的力量，而且因为祖母年轻时曾夺取了不少妖怪的名字，并把名字都记在了《友人帐》上，使不少妖怪会来找夏目希望拿回自己的名字。每一集都会描述妖怪和妖怪，或妖怪和人类的故事，把各种交错
在人与妖怪之间过着忙碌日子的夏目，偶然与以前的同学结城重逢，由此回忆起了被妖怪缠身的苦涩记忆。此时，夏目认识了在归还名字的妖怪记忆中出现的女性·津村容莉枝。和玲子相识的她，现在和独子椋雄一同过着平稳的生活。夏目通过与他们的交流，心境也变得平和。但这对母子居住的城镇，却似乎潜伏着神秘的妖怪。在调查此事归来后，寄生于猫咪老师身体的“妖之种”，在藤原家的庭院中，一夜之间就长成树结出果实。而吃掉了与自己形状相似果实的猫咪老师，竟然分裂成了3个——！？
转学到远处高中的金泽伸明，由于在之前的学校经历过的某件事，而对于与同班同学亲密相处感到恐惧，封锁了自己的内心，但他以体育祭上的班级对抗接力赛为契机，开始和同学们变得融洽起来。此时，同班同学全员的手机收到了一封自称为“国王”之人所发送的邮件。同班同学们认为这只是单纯的恶作剧而并没当回事，但只有伸明知道此事的含义，并对于要面对即将开始的“死亡”游戏感到内心纠葛……
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