故事发生在二十一世纪末，彼时，魔法早就已经不再仅存与神话和传说之中，而是同科学与超能力融合，成为了人尽皆知的存在。国家甚至成立了魔法大学附属第一高校，专门培养此方面的人才，以便更好的为国家效力。司波达也（中村悠一配音）和妹妹司波深雪（早见沙织配音）是魔法高校的新生，深雪是能力优秀的“花冠”，而达也则是作为其替补的二科生“杂草”。在学园中，兄妹两人结识了许多有趣的同伴们——个性大大咧咧不拘小节的千叶艾丽卡（内山夕实配音）、文静胆小的柴田美月（佐藤聪美配音）、正直勇敢的西城雷欧哈鲁特（寺岛拓笃配音）、认真努力
羽鸟智世（种崎敦美配音）表面看来只是一个略微冷淡的平凡少女，实际上却隐藏着可怜的身世。年幼时，智世的母亲自杀，父亲离家出走，无处可去的他在十五岁那一年成为了商品被地下拍卖会组织卖给了名为艾利亚斯（竹内良太配音）的魔法使。其实，智世拥有着夜之宠儿的特殊体质，能够在无意识之中吸收外界所散发的魔力，是十分稀有的物种。智世成为了艾利亚斯的助手，利用自己的超能力帮助艾利亚斯解决教会委托的任务。在此过程中，艾利亚斯的温柔和体贴不断的治愈着智世的内心，智世也渐渐学会了使用自己的能力去将周遭的世界改变的更加美好。
我至今，依然无法想起。自己究竟是什么——。魔法学校的学生塞维尔没有任何入学前的记忆。在不知自己为何会在这里的状态下，连校园生活也有种莫名的空虚感，由于不知道该如何努力，学习成绩也总是倒数第一。对于这样的塞维尔，魔法学校的校长阿尔巴斯突然交给他一项危险的特别实习。「我希望你前往魔女狩猎尚未根绝的区域，宣传魔法的实用性。」在魔女与教会的战争结束数年后——世界还尚未完全接受魔女与魔法。时值魔法使黎明期。这是一个无名少年和隐藏着各自的心伤的同伴们一起寻找自我的故事。
能干的程序员，同时是重度机器人宅的青年，转生到了巨大机器人“幻晶骑士（SilhouetteKnight）”震动大地的骑士与魔法的异世界！？以艾尔涅斯帝·埃切贝里亚的身份转生的他，活用丰富的机械知识以及身为程序员的才能，开始制造理想的机器人。但，他的行动演变成了超出预期的事态……！？机器人宅的野望，将改变异世界！！
すべてではない。けれど、エリアスを、自分を受け入れることができたチセ。カルタフィルスがひとときの眠りにつき、日常を取り戻した彼女の元に届いたのは、魔術師たちの相互扶助組織『学院』への招待状だった――。大英図書館の地下……今までとは違う魔術師達の社会。”人”との出会いと交わりが、新たな扉を開いてゆく。これは、私（あなた）を救う為の物語。
2095年10月31日。未观测的战略级魔法，将朝鲜半岛南端的军事都市及舰队消灭了。自从被称作《灼热的万圣节》的那一天开始，世界因新的战略级魔法师登场而震撼。其中拥有「世界最强的魔法部队」STARS的北美利坚合众国（USNA）感觉到日益强烈的危机感，为了揭露未观测的战略级魔法以及使用这一魔法的魔法师的真面目，而积极地在暗中行动。约两个月后的12月24日。就在整座城市因圣诞节的饰品和灯饰而变得热闹非凡之际，达也等人为了给准备前往美国交换留学的雫饯行，而聚集在艾尼布利榭。雫前往美国的期间是三个月。根据雫所说，和
魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「魔法科高中」，某位少女將入學就讀。容貌秀麗、完美無缺的優等生——她的名字叫「司波深雪」。深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生——優等生與劣等生的高牆……!?由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹——深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。
自魔法作为一种技术被确立以来，已经过去了大约一个世纪。 1995 年 4 月，培养魔法师的国立魔法大学附属第一高中 两兄弟姐妹进入了所谓的“魔法高中”。 作为魔术师有致命的缺陷 差生弟弟达也。 另一个被誉为完美巫师 优等生妹妹深雪。 两人如此亲密以至于有时会被误认为是恋人， 直到几年前，还被认为像女主人和仆人， 这是一段冷淡的关系。 这种关系的变化背后有一个事件。 三年前的冲绳，由于深雪难忘的事件， 他们的心和他们的命运将发生巨大的变化。
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