故事发生在二十一世纪末，彼时，魔法早就已经不再仅存与神话和传说之中，而是同科学与超能力融合，成为了人尽皆知的存在。国家甚至成立了魔法大学附属第一高校，专门培养此方面的人才，以便更好的为国家效力。司波达也（中村悠一配音）和妹妹司波深雪（早见沙织配音）是魔法高校的新生，深雪是能力优秀的“花冠”，而达也则是作为其替补的二科生“杂草”。在学园中，兄妹两人结识了许多有趣的同伴们——个性大大咧咧不拘小节的千叶艾丽卡（内山夕实配音）、文静胆小的柴田美月（佐藤聪美配音）、正直勇敢的西城雷欧哈鲁特（寺岛拓笃配音）、认真努力
深夜，挥舞巨大钢筋袭击人类的亡灵“钢人七濑”。是单纯的都市传说，还是真正的亡灵？给予妖魔鬼怪们智慧的巫女——岩永琴子，与之正面抗衡。为了消灭由人类想象力创造的恐怖妖怪，为了对抗虚构，琴子设下了由虚构组成的重重机关。
男高中生比企谷八幡（江口拓也配音）性格别扭，孤僻乖张，既交不上朋友，也不敢跟女生说话。老师布置了“回顾高中生活”的作业，他却通篇愤世嫉俗之言，最后还发出了“给我爆炸吧”的诅咒。老师因此强行将他带去了只有一个部员的“侍奉部”，希望可以改变他的性格。这个社团的活动，就是拥有者将以慈悲之心施予贫乏者，简单地说，就是侍奉部里的志愿者向有困难的人伸出援手。侍奉部部长就是校内无人不晓的雪之下雪乃（早见沙织配音），她头脑聪明，长相可爱，却为人高傲。雪之下要纠正比企谷的问题，而他却表示不必。因此老师提议他们决一胜负，赢的
2095年10月31日。未观测的战略级魔法，将朝鲜半岛南端的军事都市及舰队消灭了。自从被称作《灼热的万圣节》的那一天开始，世界因新的战略级魔法师登场而震撼。其中拥有「世界最强的魔法部队」STARS的北美利坚合众国（USNA）感觉到日益强烈的危机感，为了揭露未观测的战略级魔法以及使用这一魔法的魔法师的真面目，而积极地在暗中行动。约两个月后的12月24日。就在整座城市因圣诞节的饰品和灯饰而变得热闹非凡之际，达也等人为了给准备前往美国交换留学的雫饯行，而聚集在艾尼布利榭。雫前往美国的期间是三个月。根据雫所说，和
这是一个神灵真实存在的世界，正如神话中所流传的那样，诸神在各自的领域中发挥着不同的作用。但是，逐渐的，有一些邪恶的神开始无法安分守己，他们的欲望和权利想要的到伸张，也会带来毁灭性的灾难。于是，一些有特殊能力能够杀死神灵的少年和少女们出现了，我们称他们为弑神者。草薙护堂（松冈祯丞配音）是一个普通的高中生，一次偶然中，他打败了军神继承了他的能力，从此，一条弑神的道路在护堂面前展开了。与此同时，少女艾丽卡（日笠阳子配音）、巫女万里谷祐理（花泽香菜配音）、艾丽卡的好友利利亚娜（喜多村英梨配音）等人也都逐渐发现了自
季節は過ぎ、もうすぐ二度目の春――。劣等生の兄と、優等生の妹。ふたりの魔法科高校での生活は、その一学年目を終えようとしていた。達也、そして深雪たちは春休みを利用して、小笠原諸島のとある別荘へと休暇に訪れていた。束の間の休息に羽根を伸ばす達也たち。しかし、そんな達也たちの前にひとりの少女“九亜”が現れる。海軍基地から脱走してきたその少女は達也にひとつの願いを告げる――。
内向老实的初中二年级学生小凑露子（加隈亚衣配音）转学来到新的学校，性格使然让她无法和新同学自然交流，没有手机更成了阻碍沟通的一大鸿沟。为了帮助妹妹顺利迈出这一步，露子的哥哥步买了时下正流行的卡牌桌游《WIXOSS》。玩家可用游戏提供的卡片战斗，据说胜利后有资格实现自己的愿望，而一旦连输三次不但无法实现愿望，还会和游戏中的“LRIG”交换身份。露子就这样邂逅了“LRIG”小玉（久野美咲配音），借助WIXOSS她也结识了红林游月（佐仓绫音配音）、植村一衣（茅野爱衣配音）、苍井晶（赤崎千夏配音）等人。属于少女的
小奏露子（加隈亚衣配音）是一位个性十分普通的女子初中生，个性有些害羞和软弱的她来到了新的城市入读了新的学校，正在为自己能否交到朋友而苦恼着。哥哥小凑步（石谷春贵配音）发现了妹妹的困扰，于是将名为“WIXOSS”的卡牌给了妹妹，希望妹妹能够通过游戏来收获友谊。让露子没有想到的是，当她拿出了主牌“LRIG卡片”时，卡片上的立绘少女小玉（久野美咲配音）竟然来到了现实之中，不仅如此，露子的同班同学红林游月（川澄绫子配音）还向露子提出了对战的请求。原来，在LRIG卡片的拥有着之间，存在着旷日持久的战争，最终胜利的人
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