U. C.0097时期,“拉普拉斯事变”的纷争终结后,2架独角兽高达被秘密封印,新吉翁残党“袖章”也随之瓦解。就在人类逐渐走出战争带来的阴影之时,失踪两年的独角兽三号机“凤凰”突然现身,拥有颠覆世界秩序力量的它即刻引发了地球联邦军、吉翁袖章残党以及路欧商会三方势力的争夺狩猎,一场宇宙对决也即将拉开帷幕
2035年,经历了“赤道之冬”濒临灭亡的大危机后,残存的人类确立了世界新秩序,即由机器人“Gigantic”作为国家代表而战斗的“WWW”(Wisest World War)。全世界用于代表战的机器人Gigantic共有12架,其中代表日本的驾驶者是13岁的少年州倭慎吾和14岁的少女神代真名。由于世界能源革命和政变不断发生,两人一机的战斗于是开始了……