U. C.0097时期，“拉普拉斯事变”的纷争终结后，2架独角兽高达被秘密封印，新吉翁残党“袖章”也随之瓦解。就在人类逐渐走出战争带来的阴影之时，失踪两年的独角兽三号机“凤凰”突然现身，拥有颠覆世界秩序力量的它即刻引发了地球联邦军、吉翁袖章残党以及路欧商会三方势力的争夺狩猎，一场宇宙对决也即将拉开帷幕
究竟是什么塑造了真正的你？电影将聚焦乔伊·高纳（杰米·福克斯配音）。这位中学音乐老师获得了梦寐以求的机会——在纽约最好的爵士俱乐部演奏。但一个小失误把他从纽约的街道带到了一个奇幻的地方“生之来处”（the Great Before）。在那里，灵魂们获得培训，在前往地球之前将获得他们的个性特点和兴趣。决心要回到地球生活的乔伊认识了一个早熟的灵魂“二十二”（蒂娜·菲 配音），二十二一直找不到自己对于人类生活的兴趣。随着乔伊不断试图向二十二展示生命的精彩之处，他也将领悟一些人生终极问题的答案。
21世纪第一个十年，人类世界依然未能得到与所谓的高度发达文明相匹配的和平与安宁，超能力罪犯不断越狱，制造祸端；国际上比亚利亚和珀戈利斯坦两国剑拔弩张，人民遭难。超人（乔治·纽伯恩 George Newbern 配音）虽然不断与各种强大邪恶的对手作战，但他坚决不杀人的原则令其饱受质疑与指摘。在偶然的机会，他发现了几个年轻人组成的超能战士组合——极英盟。极英盟实力强大，个性鲜明，很快便成为新一代为民众所追捧的正义英雄。谁之不久之后，超人与极英盟成为了势不两立的对手……
