主角工藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦探，在目击黑暗组织的地下交易后，正准备追踪时却被突袭击昏，并被灌下代号为“APTX4869”的不明药物。后来虽然幸免于死，但身体就此缩小为小学时期的模样。之后他化名为江户川柯南，在邻居阿笠博士的建议下，寄住在女友毛利兰的父亲—侦探毛利小五郎家中，继续秘密从事追查黑暗组织的工作，并私下探寻获得解药的管道，希望能够恢复原来新一的样貌。与此同时，柯南凭着自己的推理天份，配合阿笠博士为他发明的道具，帮助毛利小五郎成为出名的大侦探。故事内容当中穿插许多爱情、友情、犯罪、背叛、
主角工藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦探，在目击黑暗组织的地下交易后，正准备追踪时却被突袭击昏，并被灌下代号为“APTX4869”的不明药物。后来虽然幸免于死，但身体就此缩小为小学时期的模样。之后他化名为江户川柯南，在邻居阿笠博士的建议下，寄住在女友毛利兰的父亲—侦探毛利小五郎家中，继续秘密从事追查黑暗组织的工作，并私下探寻获得解药的管道，希望能够恢复原来新一的样貌。与此同时，柯南凭着自己的推理天份，配合阿笠博士为他发明的道具，帮助毛利小五郎成为出名的大侦探。故事内容当中穿插许多爱情、友情、犯罪、背叛、
荒芜的沙漠中有一座与世隔绝的世外桃园，名叫81号农场。在很久以前有一只外星精灵意外坠落到了这里，他叫做麦咭。孩子王小宝、呆萌胆小的蛋蛋和常犯迷糊的波波是麦咭最好的小伙伴。孩子们一只有个梦想，那就是“飞翔”。 在夜色的掩护下，田鼠盗粮团正潜入农场盗窃粮食，而可怕的飞天魔鬼也杀进农场执行秘密任务——捕捉麦咭。沉浸在黑暗中的81号农场，危机四伏。看清这一切的四个小伙伴知道该起飞了，为了梦想和家园而战！一切准备就绪，四个小伙伴驾驶着终极战机飞上天空，农场陷入了激烈的空战。他们用聪明才智击溃所有敌人，保卫了麦咭和自
城市守护者黑猫警长在听说一只耳越狱出逃的消息后，立刻组织追捕。可这次追捕行动却被意外出现且拥有强大超能力的坏蛋大猿先生所破坏。隐隐有不详预感的黑猫警长在深入调查后发现，一只耳和大猿先生早已狼狈为奸，并计划着利用“翡翠之星”航天博物馆的开幕式，启动会飞的博物馆”翡翠之星”，把全城居民统统流放去宇宙！为了阻止坏蛋的行动，黑猫警长必须赶在他们之前拿到启动飞船的能源。
新宿区东侧……极尽混沌的街区中心，是霓虹闪烁的歌舞伎町。光线愈强则暗影愈浓，在恶人潜伏着的黑暗更深处，侦探长屋的灯光长明。哈德森夫人所经营的这间长屋，聚集着各种古怪之人。野心满满的洁癖侦探、迷惑男人的姐妹侦探、落魄刑警大叔侦探、被黑道驱逐的不良侦探……而其中的压轴人物，是酷爱落语的天才侦探夏洛克·福尔摩斯。开膛手杰克引发猎奇杀人的那一夜，舞台拉开了序幕。侦探之间的互相欺骗为纬，夏洛克、华生、莫里亚蒂三方牵制的友情为经……神秘？或是喜剧？无法判别的戏剧就此开演～。
正义感满满的大学生中田正义某晚帮助了被醉鬼纠缠的美貌外国人理查德。了解到理查德是个宝石商人之后，中田拿着祖母生前一直珍藏的戒指拜托理查德鉴定。通过理查德的鉴定揭开了祖母的过往，真相与心愿。借此，正义开始在理查德在银座宝石店“Jewelry étranger”打工。每天在揭开这些被带到étranger来的各样“谜团”的过程中，理查德和正义的关系也发生了微妙的变化。但是彼此都隐藏着不可告人的秘密。俊美宝石商和正义感满满的大学生交织出的宝石推理正在拉开帷幕——
密室杀人、凭空消失、不可能犯罪、漂浮的尸体、一秒内的斩首……一名“不思考就会衰老而死”的天才美少女，凭借超越常人的IQ，以“逻辑之力”为武器，以生命为赌注，与呆萌理科学霸男共同应对一系列匪夷所思的离奇事件，击破一个个闻所未闻的犯罪手法，解开留存于世间形形色色的谜。
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