故事内容延续第一部TV版《攻壳机动队 STAND ALONE COMPLEX》的剧情继续发展。但TV版的2部作品与剧场版无甚联系，可以看做是两个平行世界里发生的事情。这次TV版第2季的制作班底与第一部相同，同时剧情表达上和第一季一样，每话由不同故事构成，各自独立成章，却贯穿着同一条主线。在剧情上同时电影版导演押井守也参与了协力，不过电影版中凄凉的气氛没有在TV版第二季中体现。
在卡姆生活的15岁少年泽多（ゼッド，Zed），每一天都过着居无定所的艰辛日子，对于这里抑郁苦闷的生活备感焦躁，同时也对不时出现的梦境和自己的意义抱有疑问。他渴望前往不受束缚，能够自由生存的地方。某日，泽多被不可思议的风引领到城市的一角，在风汇聚之处打开了神秘的光圈，耀眼的光芒中出现的精灵挥舞着翅膀飞入光圈，如梦境看到的景象一般！跟着风的导向，泽度义无反顾的跳进了光圈，也许他所追寻的“答案”就在前方……
偶像，是女孩子们一直以来的憧憬。但能站在顶点的，只有仅仅数人。13位少女，就此经她们所属的事务所“765 Prodution”，跨进了那个充满竞争的世界。出道约半年，事务所来了一位全新的制作人。他跟少女们都下定决心，向顶级偶像之路进发。《偶像大师》（THE IDOLM@STER、アイドルマスター）是Namco（当时）于2005推出的“偶像培育体验游戏”系列，以其独特的设定和充满魅力的角色吸引着大量的玩家。目前已推出数部系列作品，两度被改变成动画。
从小一起长大的六个孩子，在升上高中之后彼此有了距离。不太与人们接触的宅男宿海仁太、有点被小太妹熏染的安城鸣子、进入重点高中的松雪集与鹤见知利子、放弃读高中而展开旅行的久川铁道……只有幼年死去的本间芽衣子（只有仁太能看见的灵魂），还是单纯一如从前。有一天，芽衣子对仁太说：“帮我实现一个愿望吧。”仁太虽然有点为难，却还是答应了她。以此为契机，为了实现芽衣子的愿望，分散的大家又再次聚集在一起……
故事舞台设立在太阳系被称为奇居子的谜之生命体破坏殆尽后的1000年后，在维持人类繁殖和生产、于宇宙中飞行的播种船希德尼娅上生活的主人公谷风长道成为了巨大人型兵器“卫人”的操纵士训练生，作品讲述的便是主人公与同伴们一起同奇居子战斗的故事。 动画《希德尼娅的骑士》改编自日本漫画家贰瓶勉作画的同名漫画。该作在过去作品相同的SF漫画类型的题材之上，融合了机器人、学园恋爱等要素，是一部构筑了自己独特世界观的战斗SF漫画。
长时间的假期就要结束，新的学期就要开始。站在讲坛上的新校长，迎接结束了休假而回到学校的学生们。突然的校长交替，这位新校长要实行的学校改革是……？青春的故事第2幕，开始。
神之谜题是以解谜为题材的原创动画，舞台是私立学院学员高等部，主人公是对谜题十分着迷并自信逢谜必破的高一学生大门。有一天，他受到学生会长邀请，同青梅竹马少女野叶一起前往学校附近的遗迹解“不能解开之谜”，原来这是一个由神秘智能集团制造出的能危机人类生命的“贤者之谜”。可是热爱解谜的大门硬要作出挑战，在得到某件“物件”之后，大门即被点名成为所谓的“解答者”。从此，他就与野叶和其他充满个性的解答者一起挑战潜藏于世界各地的“贤者之谜”。
少女真鱼从小时候开始就在小村落的宅邸里由婆婆抚养长大，现在已经15岁了。而一直在寻找人鱼的青年涌太，终于来到了这个村落。村落里的老女人们包围住涌太，用鱼叉刺伤了他，并把他丢入洞穴里。但是，涌太却没有死。发现了人鱼尸体的涌太，又出现在真鱼的家中，与老女人们打了起来，并背负着真鱼谋求逃走。逃入洞穴的涌太，为真鱼解开了一直带着的脚镣。还告诉了她，自己因为以前吃过人鱼肉而变得不老不死，并听说如果能遇到人鱼的话也许可以重新变回普通人的事情.........
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