当HYDRA的秘密不再是秘密之后，该剧便可以全力在这方面展开剧情了。在第二季中，新任神盾局局长Coulson和他的团队成了「通缉犯」，HYDRA组织仍在追杀他们，而且能够调动的资源已经非常有限，但那不会阻止他们继续「为世界的和平与安全而战」——毕竟已知的和未知...
ABC官宣正式续订《神盾局特工》第六季！不过往季都有22集而本季却只有13集，且在夏季播出，即在《复仇者联盟4》上映后。
钢铁侠托尼·斯塔克在国会听证上拒绝交出最新技术。与此同时，他发现胸口的微型电弧反应炉正迅速造成血液的钯金属中毒。沮丧的托尼将斯塔克公司的总裁职务交予了秘书波兹，由她全权负责正在进行的纽约斯塔克博览会。波兹从法律部门调来助理娜塔莉照顾托尼。托尼在媒体前的高调亮相引起了其父当年同事的儿子，伊凡的不满。为了实施报复，他子承父业，研制出了一套可与钢铁战衣相媲美的装备。伊凡的技术引起了托尼的竞争对手，军火商贾斯丁·汉默的注意，他设法将伊凡劫持出狱，秘密研究取代钢铁侠。正当托尼苦于钯金属中毒造成的失意之时，他发现娜塔
居住在埃兰谷的姬尔·强森（凯米拉·贝尔 Camilla Belle 饰）是一个普普通通女高中生，由于她煲电话粥过长，因此父亲本（克拉克·格莱格 Clark Gregg 饰）命令她当保姆赚取花费。万般无奈，姬尔只得应征来到曼卓基斯医生（Derek de Lint 饰）的家中。曼卓基斯及其夫人凯丽（Kate Jennings Grant 饰）住在一幢豪华的湖畔别墅中，屋内的装饰奢侈高贵，令姬尔目不暇接。她当晚的工作很简单，就是在曼卓基斯夫妇外出用餐时留下看家，并照顾他们两个正在生病的孩子。不久夜色降临，偌大的
BAU针对神秘“金星”的调查仍在继续中。在阴谋逐渐被解密的过程中，连环杀手Elias通过谈判达成协议，把自己转移回了BAU后院的联邦拘留所，BAU因此遇到了意想不到的复杂情况。这支团队面临着迄今为止最大的威胁，并且无法从令人匪夷所思的后果中全身而退。
