ABC官宣正式续订《神盾局特工》第六季！不过往季都有22集而本季却只有13集，且在夏季播出，即在《复仇者联盟4》上映后。
复仇者联盟以及随后影响深远的纽约之战，让外星人和超能力者不再是坊间传说的秘密。纽约之战过后，世界格局即将重新洗牌，野心家们则蠢蠢欲动，神盾局面临前所未有的挑战。在此危急关头，一度传闻死于纽约的特工
当HYDRA的秘密不再是秘密之后，该剧便可以全力在这方面展开剧情了。在第二季中，新任神盾局局长Coulson和他的团队成了「通缉犯」，HYDRA组织仍在追杀他们，而且能够调动的资源已经非常有限，但
美国中情局干员杰克·雷恩（哈里森·福特HarrisonFord饰）再次卷入一场错综复杂的贩毒战争之中。因前任陆军上将罹患癌症，雷恩被任命为CIA副局长一职，奉命调查美国总统友人遭毒贩谋杀事件。总统好友及其家人在睡梦中惨遭贩毒集团毒害，为查明真相，雷恩开始追查。然而，雷恩发现其好友居然与哥伦比亚贩毒团有染，不仅如此，总统也派出了一支秘密突击小组对付毒贩集团，并已前往消灭贩毒集团。不明真相的雷恩，不仅置身于利益纷争的国际政治阴谋之中，更陷入敌友难辨的两难之境。事态演变得愈发扑朔迷离，被蒙在鼓里的雷恩势要以身试
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