反黑组警长警长肥沙，不慎丢失手枪。这件事非同小可，如果手枪被匪徒用去行凶，肥沙将大祸临头。PTU警官何文展出于义气，答应一定会在天亮之前寻回手枪，带几名手下开展了寻枪行动。另一方面，却在横生枝节：警员Kat死守纪律，坚持要将此事汇报上级处理；而在同一晚，CID的Madam张在接手一单黑社会谋杀案时，怀疑肥沙与黑社会有染，由此与PTU发生意见分歧。人与人，部门与部门之间的矛盾、争斗和角力，在夜幕中徐徐拉开。而第二天清早，揭晓的真相，原来都在他们的意料之外…
曾混迹黑社会的印度裔男子维路出狱后，一心过回正常人生活，可惜人在江湖，身不由己。他最疼爱的弟弟跟随当年好友混入黑道；曾经的老大黑摩利据说也返回香港，图谋杀害机动部队陈督察；警官肥棠则隔三差五找到维路了解线索。维路不胜其扰，却又无可奈何。另一方面，香港油尖旺鱼龙混杂，各方势力暗流涌动。森和May所率领的机动部队一面要平息黑道势力的争斗，同时还要四处追查黑摩利雇用的刀手。最终形势将朝何方发展？
重案组肥棠嗜赌成性，欠下高利贷，终日被放债人陈耀雄追讨。肥棠被逼无奈，竟打起警署内赃款的主意，他盗取赃款却仍填不上债务窟窿，只好藏进小旅馆躲避阿雄。PTU的沙展阿森得知肥棠私盗赃款，想方设法保护和帮助好友，却毕竟能力有限。偶然机会，肥棠和隔壁四个潮州同乡相识，更因其专业车手的经历和技术得到对方赏识。不曾想这四人竟是内地过来的悍匪，他们力邀肥棠入伙，为金钱和道义所惑的肥棠踟蹰不定。迷途的警察能否找到归来的路…
香港庙街，各路势力云集，犬牙交错。身体残疾、在黑帮老大烟铲乐手下讨生活的盲辉与大陆偷渡过来的女孩小惠相恋。PTU部队利用盲辉端掉黑社会团体和联胜的贩毒窝点，引发和联胜老大丧昆与烟铲乐的冲突。丧昆追杀盲辉之时，遭到乐之手下火爆的伏击，坠楼而死。鉴于恶性案件时有发生，警局展开大规模扑杀行动，庙街中由黑社会把持的店铺被迫关闭。烟铲乐恼羞成怒，迁怒盲辉，致使其与女友流落街头。李永森执勤途中逮捕了滋事的小惠，令盲辉对这个导致自己幸福破碎的沙展萌生恨意……
香港最大黑社会帮会“和联胜”举行两年一度的办事人选举，阿乐与大D作为两大地区领导，暗地里展开争夺宝座的努力，一众有投票权的元老亦为自身利益而明争暗斗，选举因此相当不顺利。 结果，阿乐再次获选成为办事人，满心不服的大D决定挑战帮规，他要抢夺到象征最高权力的信物龙头棍，组织新帮会。五名小头目牵连其中，为争夺龙头棍展开连番内斗。最终鹿死谁手，一切不得而知。
陈国忠是一个事业走到低潮的资深警探，王宝是一个想把证人灭口的黑帮大佬，前者的任务就是要保护证人的女儿。陈国忠想提早退休，马军一心要取代陈成为重案组掌舵人，至于Jet ，则是王宝手下的冷血杀手。 当马军加入重案组后，该组就有一个卧底被发现已死去三天。陈国忠认定是王宝所为，派人拘捕他。可是由于无证据，黑帮大佬知道警方会放走他。为了设法令黑帮大佬入罪，陈决定制造假证据。
警员志德奉命协助邻组追查Elaine自杀案，得以跟随警局内的偶像启安办事，而暗恋他的琪琪也默默支持。当发现Elaine无自杀动机，而生前爱上网，决在此线索追寻下去。警方觅得「死亡网页」，欲引出网主，派琪琪假扮想寻死的人。当警方到场以求一网打尽时，琪琪已被逼堕楼身亡。志德从琪琪电邮知道她对自己钟情，感到懊悔，欲亲身上网寻出凶徒，却已误中圈套、身陷险境······
4吨毒品秘密抵达香港后人间蒸发，幕后黑手竟是看上去人畜无害的律师林阵安（刘德华饰）。借助暗网直播贩毒，一边杀人一边利用法律脱罪，无恶不作的林阵安不知道自己已悄悄被警察和仇家锁定。最好的兄弟、最爱的妻子先后遭遇变故，穷途末路的他彻底疯狂，想要让全世界付出代价……
