自2002年X档案的六年后，前联邦探员丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）调任某教会医院担任医师，福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）则过着隐居的生活，继续着对超自然现象的关注。某天，FBI探员前来请求他们的帮助。原来一段时间内，维吉尼亚州接连有数名女子神秘失踪，其中甚至包括一名联邦探员。由于神父约瑟夫（Billy Connolly 饰）声称看到了犯罪画面，因此FBI希望对超自然案件有着丰富经验的穆德和斯科莉协助调查。然而随着调查的深入，穆德和斯科莉
卫斯理，一个从事跟踪、调查神秘事件的男人，是联合国外星生物分析局的特别成员，处理地球上一切和外星生物有关的事件。一次，卫斯理在古董店参观一块奇异的蓝色人骨时，遇到了少时曾有一面之缘的蓝血人-- 拥有蓝色血液的外星人，「她」的名字叫方天涯，外表就和一般美女无异。卫斯理正想留住方天涯，这时附近却发生了一宗外星生物突袭事件，美国的外星生物调查机构--隶属FBI的Double X Unit小组 奉命到场，由队中精英白素和白奇伟兄妹领队。白氏兄妹带领着X组精锐部队进入事发大厦，与具有A级战斗力的外星生物交战。卫斯理
21世纪第一个50年，人类没有迎来最终的繁荣与和平，反而陷入旷日持久的星际战争中。地外文明辛塔利入侵地球，无数人类的勇士前仆后继，战死沙场。时间来到2079年。为了最终摧毁外星入侵者，人类加紧对新式武器的开发。斯宾赛·奥哈蒙（加里·希尼斯 Gary Sinise 饰）是武器研发部门的工程师，他的研究取得突破，新式武器的诞生指日可待。而就在这关键时刻，斯宾塞的身份遭到质疑。政府怀疑他是辛塔利派来的间谍，其体内更藏有一颗威力强大的炸弹。他虽然不断辩解，但无济于事。眼看命悬一线，斯宾塞伺机逃亡。他一面躲避政府的
