美国FBI探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼DavidDuchovny饰）童年时曾经历一起离奇神秘的绑架案，他的妹妹萨曼莎在睡梦中被外星人劫持，至今下落不明。从此穆德便专注于神秘事件的研究，并专门负责FBI总部的X档案部门。因穆德行事乖张，难以驾驭。FBI高层从联邦调查局学院调来女性探员黛娜·斯科莉（吉莲·安德森GillianAnderson饰），表面上是协助穆德工作，实际上是希望这名崇尚科学的理性探员能够制约穆德的行为。两人最初的合作并不理想，完全不同的思维模式时刻导致争论的爆发。但随着各种离奇案件的出现以
继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别探员不该进入的地方”搜集需要的资料。本季发展越来越精彩，一些没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖民阴谋。史考莉被绑架时子宫被移除，但今年却出现了她的孩子——艾蜜莉。今年制作小组甚至找了两位知名科幻小说家操笔，客串写出两集剧本。另外今年也有一集喜剧。整出X档案为了配合电影的上映，加入了一些角色及内容，“辛迪加”组织的阴谋越来越明显，穆德再一次接近事实的真相。穆德前女友的出现也对穆德与史考莉间
在电影FTF里出现的变种alien从一个基因技术研究公司的员工肚子里钻出来逃跑了。Mulder和Scully找到了Gibson，他带Mulder去找那个alien。Scully证明出Gibson可能是外星人（所有人类都可能是）。X档案现在由Spender和Fowley主管。Gibson最后又不见了。
穆德（DavidDuchovny大卫•杜楚尼饰）被外星反叛者劫持，而斯科莉（GillianAnderson吉莲•安德森饰）亦同时发现自己怀有身孕。穆德的办公室被搜查，斯科莉请求Skinner（MitchPileggi饰）帮助寻找搭档，孤枪侠也参与进来。FBI高层则派出探员约翰•多格特（RobertPatrick罗伯特•帕特立克饰）协助调查，但两个人的初次会面不欢而散。调查局发现穆德的单位密码和信用卡在失踪后的几天都有使用纪录，甚至发现了刻有穆德生卒年月的墓碑。多格特认为穆德假装失踪，以便盗取资料独自调查。
Mulder在医院被Fowley监管着。他想办法请来了Skinner和Kritschgau来帮忙，他们了解到Mulder拥有了CIA一直在研究的读心术。Scully在象牙海岸寻找治愈Mulder的办法。Mulder的病情加重了。
史蒂夫·卡瑞尔与史蒂夫·布西密的两位魔术师搭档在拉斯维加斯叱咤多年，如今时代流转，他俩过气的表演风格已很难吸引观众，而此时由金·凯瑞饰演的新晋魔术师以各种炫目狂野无下限的新奇表演日渐蹿红，这让两位“史蒂夫”心生妒意，彼此间的关系也开始紧张起来。从预告来看，史蒂夫·卡瑞尔与金·凯瑞两大喜剧天王将自己的看家本领尽数使出，前者囧囧的冷幽默与后者极尽恶搞的癫狂秀对比强烈，而老戏骨艾伦·阿金饰演的魔术宗师令人眼前一亮，片尾抖出的包袱萌感十足。
在上一季结尾中House大叔被送进了精神病院，这位医神大叔在精神病院会发生什么事情呢，那就尽请期待9月21日周一晚两集联播的House。
《本能》讲述曾任职中央情报局的情报员Dylan（Alan Cumming饰），离职后的他原本想建立了一个「正常」的生活，当起一位有才华的教授兼作家，不过当纽约警察向他寻求协助，希望他阻止个在逃的连
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