随着人类大规模的从事宇宙活动，在人工卫星上生活的调整者和在地球上生活的自然人之间的矛盾日益尖锐。在C.E70年2月14日，被后人称之为的“血色情人节”，由调整者殖民卫星组成的专门军事组织“Z.A.F.T.”，即扎夫特，和以大西洋联邦为首的地球联合军终于撕破脸，惨烈的宇宙战争自此爆发。调整者阿斯兰（石田彰配音）的母亲在“血色情人节”里不幸丧生，让其决定加入扎夫特，参与夺取由地球军秘密研制的新型高性能机动战士的计划。与扎夫特对立的地球军则积极反抗，阿斯兰的儿时好友，同样身为调整者的基拉（保志总一朗配音）偶然中
故事背景为日本的江户时代，风是一家小茶馆的侍女，这天茶馆里来了一群地方恶霸，其中地方官儿子龙次郎尤其欺人太甚。风因为意外得罪了龙次郎，情急之下，茶馆内一名无职浪人“无幻”出手救了风。另一方面，地方官正在欺压老百姓，流浪武士“仁”路见不平拔剑相助，杀死了地方官身边的四个“高手”保镖，救下了穷人，因此得罪了地方官。随后，无幻和仁在茶馆里相遇并交手，忽然一场大火将他们困住，二人随之被捕。因儿子在大火中丧生，恼羞成怒的地方官勒令将二人砍首。砍首之日二人大闹刑场，并且在风的帮助下，从刑场中逃出来了。作为代价，风要求
从人类开始开发宇宙开始进入A.C.（AfterColony）纪年，在第一个宇宙殖民地L1完成后百年，地球统一政府对殖民地以武力实行高压统治。在A.C.165宇宙住民对地球圈发起抗争，而在其中的调停者是非暴力非武装份子的希罗·維，并在各殖民地和地上展开演说推广其理想，但其在A.C.175遭到暗杀（其中一种说法为杀手是OZ前身的特务组织的成员），随后殖民地陷入混乱并遭到特务部队（后来的OZ前身）镇压。之后在地球上提倡和平主义的山克王国和其王室匹斯克拉福特家族也遭消灭。A.C.195年强力反对地球统一政府强力支
日本的上班族冈岛绿郎在一次去东南亚的出差中,被和海盗差不多的运输商BLACK LAGOON的成员绑架。公司为了保守机密派遣雇佣兵要抹煞掉成为了人质的冈岛,但是冈岛凭借其智慧从这绝境中脱险了。被公司抛弃的冈岛舍弃了了姓名和立场,改名Rock成为了BLACK LAGOON的成员。原军人的老板Dutch,机械工Benny,有双枪别名的枪手Revy,和Rock一起,乘坐改造鱼雷艇BLACK LAGOON号在南方的大海上驰骋着而女主角则是美女双枪侠·蕾葳,任何危险的工作她都可以胜任！
雏见泽是一处坐落在群山环绕之间的僻静村庄，淳朴的民风使得这个古老的村庄一直以来都保留着祖先时代的祭祀习俗，称为绵流。昭和58年的一个夏天，这个村庄迎来了一个新的居民：少年前原圭一（保志总一朗配音）。新的环境让圭一有些不太能适应，但在结识了温柔的龙宫礼奈（中原麻衣配音），活泼的园崎魅音（雪野五月配音），外表孱弱却内心坚强的北条沙都子（金井美香配音）和古手梨花（田村由里香配音）后，新的生活很快便如火如荼的展开了。随着时间的推移，一年一度的绵流祭奠即将开始，然而在此热闹之际，圭一却听闻了一些雏见泽不为人知的过去
獅子王凱是改造人，改造他的父亲獅子王麗雄在他体内放入了神奇的宝石Gストーン。獅子王凱地球的和平，和邪恶的ゾンダー展开了战斗。
黑主学院是一所有名的寄宿制学校，学校分为普通部和夜间部。夜间部的人员各个都是精英学员，并且都有超美型外表。但其实夜间部的学生都有个特殊的身份：吸血鬼！并且这个身份不能给普通部学生知道。理事长黑主灰阎的义女和普通部学生的黑主优姬和青梅竹马的锥生零守护着这个学院，处理人类学生与吸血鬼接触时所出现的麻烦。而在零的内心深处，则痛恨着吸血鬼，因为四年前他的家人被吸血鬼所杀害，只有他零奇迹般的活了下来。而优姬又对曾救过自己性命的贵族吸血鬼玖兰枢产生好感。围绕着优姬谜样的身世，零身为吸血鬼猎人却成为吸血鬼的内心挣扎和对
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