故事以只有女性能使用的世界最強兵器「InfiniteStratos（IS）」為中心，在女尊男卑的世界中，主角「織斑一夏」雖然身為男生卻能夠操縱IS，為此他被強制進入培育IS操縱者的學校「IS學園」，周圍理所當然也都是女性，而女生們也對這位「世上唯一能夠使用IS的男性」感到興趣，就此展開了許多趣味橫生的學校生活。
作为“战争机器”长大的女主人公薇尔莉特·伊芙加登，在战争中失去双臂，并与收养她的少佐分离，在装上义肢后，成为邮政公司一名从事代写书信工作的“自动手记人偶”。在车马缓慢、只能以信件传递感情的年代里，“自动手记人偶”通过与委托人接触交流，代写书信，以优美准确的文字传递着人们最为真挚的感情。外传的故事中，薇尔莉特·伊芙加登接到了一桩特殊的委托工作……
在帕特里亚大陆诞生的民主主义国家“帕特里亚”。在由于经济不平衡而导致分裂成“北部帕特里亚同盟”与“南部帕特里亚联合”的这个国家，持续着长年的内战。陷入了劣势的北部，为了战胜南部，终于用上了禁忌的技术。将人类改造成异形士兵的这个技术，以人类的模样为代价，以获得与神媲美的力量。这个力量结束了长期的战乱，从此进入了和平年代。“拟神兵”，这就是被誉为“神”的救国英雄。时光流逝，战争已成为历史的现在，那些变成了“拟神兵”的人，因为那股庞大的力量，被人们称为“野兽”，为人们所惧怕蔑视着。原拟神兵部队队长·汉克，化身为
过去，在被称作冬木的城市曾举行过由七位魔术师与英灵参加的“圣杯战争”。然而趁着第二次世界大战的混乱，“某位魔术师”强行夺走了圣杯——数十年过去，千界树一族高举那个圣杯为象征，叛离了魔术协会，宣布独立。愤怒的魔术协会派遣了刺客，但他们却遭到了召唤出的Servant的反击。
15岁的少女铃原泉水子（早见沙织配音）自幼生活在熊野古道玉仓山深处。她性格内敛，不善交际，并且具有令周围电器失灵的体质。即将升入高中的泉水子情窦初开，她悄悄修剪刘海，却不知这将产生怎样无可估量的影响。女孩原本要被安排前往东京的高中求学，但为了尊重其本人意愿，监护人相乐雪政（福山润配音）安排儿子深行（内山昂辉配音）转学至玉仓山栗谷中学，肩负起保护泉水子的重任。原来泉水子作为“冯依”，体内封印着姫神的神秘力量，这种力量使得她称谓各种邪物觊觎伤害的对象。原本性格不合的少男少女，自东京修学旅行的恐慌过后相互理解。
魔法使一族的野心使他们为了获取更强的力量，促使他们唤醒了不该唤醒的东西，世界的毁灭近在眼前。只有最强的魔法使公主锁部叶风（泽城美雪配音）才能阻止这一切的发生，但被部下锁部左门（小山力也配音）暗算的叶风被困在了施了结界的无人岛上。高中二年级学生泷川吉野（内山昂辉配音）的好友不破真广（丰永利行配音）的妹妹不破爱花（花泽香菜配音）被入室抢劫犯所杀，但是真广却认为妹妹的死疑点重重。为了调查妹妹的死因，真广通过海上的漂流人偶和锁部叶风达成秘密交易。真广在失踪一个月后，在大雪的冬日伴随着漫天的蝴蝶突然从天而降。与此同
故事发生在一个虚构的世界之中，魔神即将从沉睡之中苏醒，世界将因此而成为鲜血和火焰的海洋，为了击败魔神使其再度沉睡，六名勇者被神意挑选了出来，他们的身上会出现花朵的纹章作为标识，人们称他们为“六花勇者”。然而，这一次，被选出的勇者却有七人，这也就意味着，性格奔放开朗的娜谢塔尼娅（日笠阳子配音）、个性冷淡沉默寡言的芙蕾米（悠木碧配音）、坚强的莫拉（佐藤利奈配音）、拥有超高智商的汉斯（铃村健一配音）、傲娇毒舌的茶末（加隈亚衣配音）、成熟稳重的戈尔道夫（内山昂辉配音）和胆小的洛洛尼亚（金元寿子配音），在这些人之中
