天正十年，爆发了左右日本战国史的最重要事件——本能寺之变，第六天魔王织田信长（筱井英介饰）霸业梦断。他的属下在继承信长遗志的同时，也展开了关于继承者的明争暗斗。丹羽长秀（小日向文世饰）和笔头家老柴田胜家（役所广司饰）主推信长的三子信孝（坂东巳之助饰）；另一方是讨伐光秀而声名鹊起的猴子羽柴秀吉（大泉洋饰），他在军师黑田官兵卫（寺岛进饰）辅佐下力推信长的次子信雄（妻夫木聪饰）。双方各自争取信长的妹妹阿市（铃木京香饰）的支持，同时争取一切可以争取到的力量。决定历史走向的清须会议召开在即，谁才是最终的胜者？
九州的阿苏地区接二连三出现去世的人重返亲人身边的事情，他们保持死亡之前的样子及记忆，为何能够死而复生？调查员川田平太（草剪刚饰）开始调查这个不可思议事件的产生原因。回到故乡后，平太与已故好友俊介的
进入了明治时代，曾经的“刽子手拔刀斋”绯村剑心（佐藤健饰）已经习惯了神谷道场的安宁生活。谁知就在这一天，倒幕战争时的旧友——号称维新三杰之一的大久保利通（宫泽和史饰）将其请去。原来继承了剑心刽子手身份的志志雄真实（藤原龙也饰）当年被新政府背叛，侥幸活下来的志志雄正秘密筹措称霸日本的可怕计划。大久保死后，深感背负不可推卸责任的剑心只身上路，在途中不仅偶遇京都女忍卷町操（土屋太凤饰），还在新月村和志志雄有了第一次的遭遇。与此同时，相乐左之助（青木崇高饰）、神谷薫（武井咲饰）、明神弥彦（大八木凯斗饰）、斋藤一（
宝町是一座与时代发展脱节、人口密集的中型工业城市，整日响着轰隆隆机器操作的声音。小黑和小白是被称之为“猫党”的人，可以腾空在城市顶端，可以滑落在纵深空间，小黑会拿着铁棍来狂扁他不喜欢的大人，小白则有着自己天真的想象世界。宝町是一个没有将来的城市，直到一家叫“KIDDYKASTLE”的公司来到这里并想把宝町改造成他们想要的样子时，恶童们知道这是为自己的生活和城市、更是为自己的灵魂而战斗的时候了。这座城市的没有规则、自由自在、清新空气、游乐设施都是属于宝町独有的！
时光流转，冷酷无情的一条圣也（伊势谷友介饰）登上帝爱会操纵者的宝座，他凭借精明贪婪的头脑和狡诈无耻的手段让无数疯狂赌徒拜倒在自己的脚下，心甘情愿掏出所有积蓄，并最终沦为地下设施内不见天日的奴隶。与此同时，暂时从地下设施中逃脱出来的伊藤开司（藤原龙也饰）设法要在14天内赚到2亿日元以解救那里的同伴。在这紧要关头，他结识了人生跌入谷底的坂崎孝太郎（生濑胜久饰）以及老对头利根川幸雄（香川照之饰），他们决定挑战帝爱会那台奖金高达10亿日元、被称为吃人沼泽的弹子机。石田大叔的女儿石田裕美（吉高由里子饰）也参与进来，
明治维新运动后十二年，日本迎来了新时代。曾经叱咤风云的刽子手绯村剑心如今已成为和平主义者，与朋友们一起在东京过着平静的生活。一天晚上，剑心最喜欢的餐厅遭到炮火袭击，只留下一张写着“人诛”的字条——有人准备替天行道，审判之日近在眼前。此人名为雪代缘，对剑心怀恨在心，带着一众手下前来复仇。目睹无数无辜之人被牵扯进这场残酷的斗争，剑心终将面临一场审判，并由此找到对过去的救赎。
《新宿天鹅2》的故事舞台随着同名漫画续作发展，搬到了日本横滨上演。男主角白鸟龙彦（绫野刚饰）将与浅野忠信所饰演的“横滨巫师”社长泷正树正面对抗，在漫画中，泷正树是“新宿天鹅史上最恐怖的敌人”，这个角色，由怪咖影帝浅野忠信来演绎简直再合适不过。
少女幸子（宫崎葵饰）和老师的师生恋绯闻被传得风风雨雨，相依为命的母亲稔子（Ryo饰）则自杀未遂。打击不断的生活令幸子无法承受，升入中学后，她不去上学，每天闲逛打发时间。她和依靠小偷小摸赚钱的少年隆
